vzquota : (warning) Incorrect quota shutdown for id xxx, recalculating disk usage

Такая ошибка свидетельствует, что OpenVZ квота для данного контейнера была разрушена и требует пересборки, это довольно длительный процесс (до десятков минут), но от Вас требуется одно - ждать.

vzctl start xxxxx
Starting container ...
vzquota : (warning) Incorrect quota shutdown for id xxx, recalculating disk usage
Container is mounted
Adding IP address(es):xx.xx.xx.xx
Setting CPU limit: 200
Setting CPU units: 500000
Setting CPUs: 2
Configure meminfo: none
Set hostname: yyyy.xxxx.ru
Setting quota ugidlimit: 2048
Container start in progress...