Удаление всех таблиц из базы данных без удаления самой базы

Создаем список таблиц:

mysql -u root -ppassword -Ddb-name -e 'show tables;' | grep -v 'Tables_in' > /tmp/tables_list

Очищаем базу:

for table in `cat /tmp/tables_list`; do mysql -u root -ppassword -Ddb-name -e "drop table $table;" ; done

Наблюдаем пустую БД:

mysql -u root -ppassword -Ddb-name -e 'show tables;'

Такое часто требуется, когда на таблице стоят полномочия, на известные Вам и при DROP DATABASE они будут сброшены, а вот при DROP TABLE они останутся нетронутыми.