Как войти в MySQL рутом на сервере с установленной панелью ISPManager?

Вот так:

mysql -uroot -p`cat /usr/local/ispmgr/etc/ispmgr.conf | grep Password | awk '{print $2}' | head -n1`

А дампить вот так:

mysqldump -uroot -p`cat /usr/local/ispmgr/etc/ispmgr.conf | grep Password | awk '{print $2}' | head -n1` db_name > /root/dump.sql

А импортировать так:

mysql -uroot -p`cat /usr/local/ispmgr/etc/ispmgr.conf | grep Password | awk '{print $2}' | head -n1` -Ddb_name -e "source dump.sql"